蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节，通过感应代谢环境变化而变化，同时其常在代谢酶上发生修饰，进而调控代谢通路及代谢酶的活性，参与下游游代谢物变化。蛋白质乙酰化（acetylation）是最常见的酰化修饰类型，是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团（如乙酰辅酶A等供体）共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程，主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位，其分子质量会相应增加42.01Da，质谱能够精确地测定分子量是否发生相应的质量偏移，实现酰化修饰肽段及位点的分析。 4D-label free乙酰化修饰蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行乙酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。