TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术,采用6、10及16种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,经高分辨质谱仪串联分析,可...
TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术,采用6、10及16种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,经高分辨质谱仪串联分析,可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量,是定量蛋白质组学中经典的高通量筛选技术。
◆ 同一批次标记的样本统一处理,减少样本处理及实验误差,实验平行性较高
◆ 同一批次标记定量稳定性高
◆ 通过分级方法可深度可大大增加蛋白鉴定深度
生物领域各个研究方面,如:
◆ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
◆ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
◆ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
◆ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等。
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |