iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,进行LC-MS...
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,进行LC-MS/MS分析,可同时比较多种不同样本中蛋白质的相对表达含量。
生物领域各个研究方面,如:
◆ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
◆ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
◆ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
◆ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等。
◆ 具有2-8 plex标签,可同时标记2-8组样本进行表达差异分析;
◆ 是一种体外标记技术,可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本;
◆ 不同标签混合后上机,具有较好的平行性,避免技术误差,提高检测效率;
◆ 与凝胶方法相比,iTRAQ可发现膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、强碱和强酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白质,对低丰度蛋白质亦有较好的检出率。
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |