蛋白质琥珀酰化(Succinylation)修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式,是通过酶活性催化和非酶活性催化两种方式,将琥珀酰基供体上的琥珀酰基团结合到蛋白质赖氨酸残基的过程。发生酰化修饰的氨基酸上可共价连接琥珀酰,其分子质量会相应增加1...
蛋白质琥珀酰化(Succinylation)修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式,是通过酶活性催化和非酶活性催化两种方式,将琥珀酰基供体上的琥珀酰基团结合到蛋白质赖氨酸残基的过程。发生酰化修饰的氨基酸上可共价连接琥珀酰,其分子质量会相应增加100.01Da。质谱能够精确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。 赖氨酸琥珀酰化修饰能够引起蛋白质较大的质量变化(100.01 Da),且赖氨酸琥珀酰化修饰能诱导电荷突变(+1至-1),因此赖氨酸琥珀酰化修饰能够产生更大的结构变化和电荷变化,在调控蛋白质结构和核心能量代谢功能(包括三羧酸循环、糖代谢等)方面发挥着重要作用,对线粒体失调、代谢紊乱相关疾病的研究具有重要价值。 4D-label free琥珀酰化修饰蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行琥珀酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
◆ 代谢调控:代谢疾病、代谢紊乱等;
◆ 药理药靶、基因敲除/过表达的修饰表达分析;
◆ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究;
◆ 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路;
◆ 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究;
◆ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。
◆ 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;
◆ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;
◆ 前沿技术——基于新一代质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;
◆ 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验,拥有数量与质量领先的高水平项目文章;
◆ 数据保证——采用进口金标抗体,高标准修饰富集操作,数据结果稳定可靠;
◆ 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |